หลุมศพเปลือกหอยซันกันจิ

จากการขุดค้นทางโบราณคดี 2 ครั้งในปี 1952 และปี 1954 ได้ขุดพบกระดูกมนุษย์ที่ฝั่งเอาไว้มากกว่าร้อยศพ ทำให้ทราบว่ามีผู้คนในช่วงปลายยุค ~ ใกล้สิ้นสุดยุคโจมง
กระดูกมนุษย์ไดถูกฝั่งโดยหันหัวไปทางภูเขา และบางหลุมก็ได้มีการฝั่งส่วนหัวรวมกันเป็นทรงกลมไว้เอาด้วย
จากกระดูกที่ฝั่งเอาไว้พอประมาณการได้ว่าเป็นอายุเฉลี่ยของกระดูกเพศชายจะอยู่ที่ 29.2 ปี และเพศหญิงอยู่ที่ 31.1 ปี
จากผลการวิเคราะห์ DNA ของหัวกะโหลกที่ฝั่งอยู่ในหลุมศพเปลือกหอยซันกันจิ จะได้ว่าเป็นบรรพบุรุษของชาวญี่ปุ่นที่ต่างจากที่เคยพบมา